2017年1月15日，北京清华大学马来西亚校友会召开第三次会员大会，同时进行第二届理事会【2017-2019年度】选举初选，并于2月12日举行复选，投选出新理事会阵容。
第二届理事会共有理事13名，其中包含6名新晋理事，另有顾问2人、名誉顾问2人、纪律委员3名及稽查1名，名单如下：-
顾问：纪家葵教授、刘宏毅律师
荣誉顾问：拿督陈志勇、拿督胡瑞莲
会长： 刘劲毅（物理2001、物理2006硕）
副会长： 江友强（计算机2003）
秘书长： 司徒哲阳（新闻2007）
副秘书长： 张菘芯（计算机2003）
财政： 丘君慧（计算机2003）
理事： 刘志伟（教研2011硕）、 谢诗晨（建筑2002）、 曾子原（计算机2003）、 林振忠（社科经济2005）、 蔡培勤（经管2006法双）、 黄玮翔（环境2008）、 叶芯延（社科经济2008）、 沈合一（热能2012）
纪律委员： 张维立（化工2003）、 欧阳姗姗（新闻2006）、 曾子原（计算机2003）
稽查： 杨敏业（经管2005）
